Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1Q9Y2A7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1Q9Y2A7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms