Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POMPQ9Y244 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms