Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGAP1Q9UPQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms