Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4Q9UP95 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4Q9UP95 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms