Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRQQ9UMZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRQQ9UMZ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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