Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO1Q9UM00 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms