Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI3Q9ULW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PADI3Q9ULW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI3Q9ULW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms