Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PADI1Q9ULC6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms