Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NRXN1Q9ULB1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms