Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ADAM28Q9UKQ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms