Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHIC2Q9UKJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHIC2Q9UKJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms