Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH22Q9UJ99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH22Q9UJ99 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms