Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD1Q9UIS9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms