Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms