Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL3Q9UH77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms