Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEMTQ9UBM1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms