Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms