Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CC2D2AQ9P2K1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms