Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1BQ9P298 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1BQ9P298 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1BQ9P298 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms