Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms