Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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