Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VNN3Q9NY84 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms