Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM6Q9NX76 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM6Q9NX76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM6Q9NX76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms