Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 395 ms