Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RBM28Q9NW13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms