Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPOQ9NVS9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPOQ9NVS9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms