Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTLC3Q9NUV7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms