Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms