Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L1Q9NU39 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L1Q9NU39 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms