Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms