Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL1Q9NSC2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms