Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM1Q9NRU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM1Q9NRU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM1Q9NRU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNNM1Q9NRU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM1Q9NRU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms