Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH12Q9NPG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms