Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms