Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI6

CYP4F11, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F11, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F11Q9HBI6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F11Q9HBI6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F11Q9HBI6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms