Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMYD3Q9H7B4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD3Q9H7B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms