Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM38AQ9H6F2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM38AQ9H6F2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms