Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1DQ9H5J8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms