Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX5Q9H2C1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms