Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH19Q9H159 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH19Q9H159 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH19Q9H159 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH19Q9H159 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH19Q9H159 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms