Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF541Q9H0D2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF541Q9H0D2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms