Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIF3L1Q9GZT8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIF3L1Q9GZT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIF3L1Q9GZT8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIF3L1Q9GZT8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIF3L1Q9GZT8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIF3L1Q9GZT8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms