Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COMMD5Q9GZQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms