Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

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Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A16Q9GZN6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A16Q9GZN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A16Q9GZN6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A16Q9GZN6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A16Q9GZN6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A16Q9GZN6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A16Q9GZN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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