Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms