Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM8Q9BZR9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms