Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms