Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCO2Q9BYV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCO2Q9BYV7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms