Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCAPERQ9BY12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCAPERQ9BY12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms