Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB2BQ9BVA1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms